HiSeq 2500系统的关键方法

外显子组、靶向重测序、全转录组和从头测序,以及表观遗传调节等

HiSeq 2500的应用和方法

外显子组测序可分析基因组的蛋白质编码区,可作为全基因组测序的一种经济高效的替代性选择。HiSeq 2500系统具有快速运行和高通量运行两种模式,是一个灵活的系统,每次运行可以测序5–75个外显子组*。

*假定采用2 × 75 bp的read,100×覆盖度,其中80%位于目标区域。

利用总RNA测序(RNA-Seq)分析编码RNA和多种形式的非编码RNA,获得完整的转录组视图。利用HiSeq v4测序化学技术,在每次双流动槽HiSeq运行40亿个read的情况下,HiSeq 2500系统每次运行可以测序最多80个转录组*。

*假定每个样本有5000万条read。

查看研究人员如何使用HiSeq系列进行总RNA-Seq测序。

基因表达图谱分析

mRNA测序(mRNA-Seq)发现已知和未知转录的同时度量转录的丰度,从而能够绘制准确而全面的表达图谱。

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大型全基因组测序

对大型复杂基因组(人类、植物或动物)进行测序可提供基因组改变的碱基视图,从而为疾病或群体基因组学的研究提供信息。

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DNA-蛋白质相互作用分析

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甲基化测序

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编码转录组分析

使用RNA编码区域的序列特异性捕获发现已知和未知的RNA外显子组特性。

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从头测序

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通过测序整个微生物群落来进行宏基因组分析,以发现重要的分类学信息与功能性信息。

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通过测序进行基因分型

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小型全基因组测序

小型基因组测序可对微生物或病毒基因组进行全面分析,有助于开展公共卫生、流行病学和疾病研究。

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miRNA和小RNA分析

分离并测序小RNA,例如microRNA,研究非编码RNA在基因沉默和转录后调控中的作用。

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靶向基因测序panel包含定义好的探针组,专注于感兴趣的特定基因。预设计的panel和定制panel均可供您选用。

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16S rRNA测序

该方法无需培养,用于鉴定和比较那些难于研究的,来自复杂微生物组或环境的细菌。

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翻译分析

核糖体分析能对细胞转译流程进行系统性监控并预测蛋白质丰度。

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靶向RNA测序(RNA-seq)主要关注特定的感兴趣的转录本,可用于分析基因表达和鉴定融合基因。

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PCR扩增子的超深度测序能够在单次分析中对多达数百个目标基因组区域进行经济有效地分析。

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细胞基因组学

新一代测序能提供逐个碱基的全基因染色体变异检测,以补充基于芯片的细胞基因组分析。

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群体研究

群体基因组学计划将大规模基因组和临床数据整合到学习型健康系统中,以推动医疗保健创新。

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测序能力见证海洋变化

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样本质量控制

在全面运行之前评估测序文库的质量,或开展生物生产研究质量控制。

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Illumina方法指南

方法指南

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