复杂的生物系统由单个细胞的协同功能共同决定。 传统方法虽然提供了大量的基因组或转录组数据,但却无法揭示造成这种复杂性的细胞异质性。单细胞测序是一种新一代测序(NGS)方法,可检测单个细胞的基因组或转录组,提供细胞间变异的高分辨率视图。
高灵敏度的超低起始量和单细胞RNA测序(RNA-seq)法使研究人员能够探索复杂组织中单个细胞的不同生物学特性,了解细胞亚群对环境要素的反应。这些检测方法有助于研究细胞功能和细胞分化、增殖、肿瘤发生等依赖时间的过程中的异质性。
单细胞和超低起始量RNA-Seq是研究转录组的强大工具,能以最小的样本起始量开展无偏差的研究。
Cole Trapnell博士是TopHat、Cufflinks和其他广泛使用的生物信息学工具的主要开发人员。他与我们分享了在他眼中了解细胞谱系的重要性,他的实验室使用单细胞RNA测序的经验,以及他对组合标签的应用。
阅读访谈录MD安德森癌症中心的Swetha Anandhan与Illumina及10x Genomics一起参加了此次在线讲座。她着重介绍了如何使用单细胞RNA测序来鉴定多形性胶质母细胞瘤中独特的巨噬细胞群,这群细胞在采用免疫检查点抑制剂治疗后仍然存在。
观看在线讲座单细胞测序的方法可分为高通量方法和低通量方法。低通量方法采用机械操作或细胞分选/分离技术,每次实验可以处理几十到几百个细胞。
微流体技术的最新进展使高通量单细胞分析成为可能,利用该技术,研究人员可以在一次实验中经济有效地检测数百至数万个细胞。高通量测序和低通量测序方法均使用了Illumina边合成边测序(SBS)技术,该技术是最广泛采用的NGS技术,产生了全世界约90%的测序数据。*
Illumina Bio-Rad Single-Cell RNA Sequencing Solution将高度创新的Bio-Rad Droplet Digital™技术(ddSEQ™)与Illumina NGS文库制备、测序及分析技术相结合。通过这个灵敏、可扩展、高性价比的高通量工作流程,深入了解基因表达。
推荐以下低通量方法给想要在特定研究中处理少量细胞的研究人员,比如一次实验处理几十到几百个细胞。
Detect cancer gene expression and transcriptome changes and identify novel cancer transcripts with RNA-Seq.
Learn MoreExpand cell and molecular biology research beyond conventional methods with next-generation sequencing.
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