Skip to content

单细胞和超低起始量RNA-Seq

单细胞RNA测序简介

复杂的生物系统由单个细胞的协同功能共同决定。 传统方法虽然提供了大量的基因组或转录组数据,但却无法揭示造成这种复杂性的细胞异质性。单细胞测序是一种新一代测序(NGS)方法,可检测单个细胞的基因组或转录组,提供细胞间变异的高分辨率视图。

高灵敏度的超低起始量和单细胞RNA测序(RNA-seq)法使研究人员能够探索复杂组织中单个细胞的不同生物学特性,了解细胞亚群对环境要素的反应。这些检测方法有助于研究细胞功能和细胞分化、增殖、肿瘤发生等依赖时间的过程中的异质性。

Want to learn valuable insights about the single-cell sequencing
        workflow? 下载电子书

单细胞RNA-Seq的优势

单细胞和超低起始量RNA-Seq是研究转录组的强大工具,能以最小的样本起始量开展无偏差的研究。

  • 对于高质量的样本,能以单细胞的起始量水平进行可靠的转录组分析
  • 整合的方案直接从整个细胞开始进行,能保留样本的完整性
  • 高分辨率的分析能够发现通常会被批量采样方法掩蔽的细胞间差异

单细胞测序与分析工作流程

单细胞测序可以揭示存在的细胞类型,以及单个细胞对复杂生物系统功能的影响。了解如何使用Illumina工作流程(从单细胞制备到分析)进行单细胞测序。

Launch Modal

单细胞测序方法

单细胞测序实验的质量控制

了解使用Miltenyi Biotec样本制备方案来制备细胞悬液的最佳操作技巧

观看在线讲座
采用多重分来析开展单细胞实验

加州大学旧金山分校的研究人员探讨了MULTI-Seq,这是一种用于单细胞和单核RNA测序的样本条形码策略。

观看在线讲座
组合单细胞技术

我们着重介绍了几项应用,您可采用完全受支持的工作流程来完成单细胞悬液制备到数据分析的整个过程。

观看在线讲座
Single-Cell Analysis is Advancing Insights in Developmental Biology

单细胞分析正在促进发育生物学的发展

Cole Trapnell博士是TopHat、Cufflinks和其他广泛使用的生物信息学工具的主要开发人员。他与我们分享了在他眼中了解细胞谱系的重要性,他的实验室使用单细胞RNA测序的经验,以及他对组合标签的应用。

阅读访谈录

单细胞测序应用

使用iSeq 100系统对文库进行质量控制和调整

评估单细胞基因表达混合文库的关键指标,在开展高深度运行前评估其质量。

阅读应用说明
使用NovaSeq 6000系统进行单细胞测序

这种可扩展、稳定的单细胞NGS方法支持在单细胞分辨率下进行常规的转录组分析。

阅读应用说明

单细胞测序的考虑因素、趋势和未来

NIHR盖伊和圣托马斯生物医学研究中心的实验室正在采用Illumina的技术进行单细胞基因组学研究,研究范围包括克罗恩病、花生过敏、细胞疗法、免疫疗法等。

Considerations, Trends and Future of Single-Cell Sequencing

单细胞测序研究相关文章

Weizmann研究所利用NovaSeq来进行单细胞研究

Amit教授正在通过单细胞分析来深入了解健康和疾病状态下的生物系统。

阅读文章
探索肿瘤微环境

单细胞测序在检测肿瘤细胞内通讯方面具有重要价值。

阅读访谈录
单细胞研究综述

查看使用Illumina技术进行单细胞测序的同行评审文献综述。

阅读综述

Immune Profiling of Human Tumors Identifies CD73 as a Combinatorial Target in Glioblastoma

单细胞RNA测序在免疫疗法研究中的应用

MD安德森癌症中心的Swetha Anandhan与Illumina及10x Genomics一起参加了此次在线讲座。她着重介绍了如何使用单细胞RNA测序来鉴定多形性胶质母细胞瘤中独特的巨噬细胞群,这群细胞在采用免疫检查点抑制剂治疗后仍然存在。

观看在线讲座
购买指南:简单RNA-Seq工作流程

RNA测序与诸如qPCR和基因表达芯片等先前的方法相比,具有许多优点。使用本指南评估新一代测序的各种选项并获得定制的工作流程。

下载指南
购买指南:简单RNA-Seq工作流程

高通量和低通量方法

单细胞测序的方法可分为高通量方法和低通量方法。低通量方法采用机械操作或细胞分选/分离技术,每次实验可以处理几十到几百个细胞。

微流体技术的最新进展使高通量单细胞分析成为可能,利用该技术,研究人员可以在一次实验中经济有效地检测数百至数万个细胞。高通量测序和低通量测序方法均使用了Illumina边合成边测序(SBS)技术,该技术是最广泛采用的NGS技术,产生了全世界约90%的测序数据。*

单个神经元

James Eberwine解释了如何在体内使用单细胞RNA测序来研究单个细胞在复杂生物体的微环境中的功能。

观看视频

超低起始量和单细胞RNA-Seq的高通量工作流程

Illumina Bio-Rad Single-Cell RNA Sequencing Solution将高度创新的Bio-Rad Droplet Digital™技术(ddSEQ™)与Illumina NGS文库制备、测序及分析技术相结合。通过这个灵敏、可扩展、高性价比的高通量工作流程,深入了解基因表达。

iSeq 100系统和试剂

iSeq 100测序系统让新一代测序比以往更简单,也更经济。它简约的设计让所有规模的实验室只需按下按钮,即可对DNA和RNA进行测序。

了解更多
iSeq 100系统和试剂
NovaSeq Reagent Kits
NovaSeq Reagent Kits

适用于NovaSeq 6000系统的试剂套件提供了随时可用的试剂盒,可用来进行簇生成与边合成边测序。

查看产品
NextSeq 2000
NextSeq 2000

突破性的台式测序仪允许您在各种现有和新兴的应用中探索新的科学研究,并提供更高的效率和更少的限制。

了解更多
Nextera XT和Nextera DNA Flex
Nextera XT和Nextera DNA Flex

为小型基因组、扩增子、质粒和其他应用制备测序文库。

查看产品

超低起始量和单细胞RNA-Seq的低通量工作流程

推荐以下低通量方法给想要在特定研究中处理少量细胞的研究人员,比如一次实验处理几十到几百个细胞。

相关解决方案

通过测序检测蛋白

能让研究人员在单个细胞中同时测序RNA和检测细胞外蛋白的方法揭示了与疾病相关的新细胞类型和状态。

更多信息
ATAC测序

ATAC-Seq是一种广泛使用的方法,它使用高活性转座酶Tn5来评估染色质可及性。它能以高分辨率在单细胞上进行。

深入了解ATAC-Seq
Cancer RNA Sequencing

Detect cancer gene expression and transcriptome changes and identify novel cancer transcripts with RNA-Seq.

Learn More
Cellular and Molecular Biology

Expand cell and molecular biology research beyond conventional methods with next-generation sequencing.

Learn More

Frequently Purchased Together

特色文献

单细胞RNA-Seq分析确定了与肿瘤特征相关的细胞通讯

研究人员使用单细胞RNA-Seq通过肿瘤微环境中不同细胞类型之间的配体-受体相互作用来表征细胞通讯。

阅读文献
人类造血干细胞谱系定型是一个连续的过程

研究人员使用单细胞RNA-Seq证明了造血干细胞谱系定型是一个渐进的过程,在这个过程中不会分化成不同的祖细胞。

阅读文献
衰老增加了免疫刺激后细胞间的转录变异性

研究人员使用了单细胞RNA-Seq来探索衰老对免疫系统的影响,观察到年龄相关的细胞间转录变异性是衰老的特征。

阅读文献
希望收到有关测序方法的快讯、案例研究和信息?请输入您的电子邮箱地址。

其他资源

The Illumina Bio-Rad Single Cell Sequencing Solution
The Illumina Bio-Rad Single Cell Sequencing Solution

利用这个用户友好型方案进行基因表达研究来分析数百至数万个单细胞的转录组。

外周血单核细胞的单细胞RNA测序
外周血单核细胞的单细胞RNA测序

深入了解单个细胞如何影响复杂组织(如外周血)的功能。

利用单细胞RNA-Seq进行干细胞研究
利用单细胞RNA-Seq进行干细胞研究

了解单细胞测序如何改变我们对干细胞发育的看法。

单细胞RNA-Seq、网络和记忆
单细胞RNA-Seq、网络和记忆

TGen的研究人员利用单细胞RNA测序来了解单个神经元如何参与记忆形成。

*根据Illumina公司2015年存档数据计算