助您可视化芯片数据,将结果转化为见解

芯片服务培训材料

我们知道管理大量数据集是一项非常艰巨的任务。为了让您熟悉芯片分析,Illumina为您提供全基因组基因分型和甲基化培训包。这些培训包囊括了用户指南、数据表、以及数据集范例。

培训解释了如何利用GenomeStudio软件分析工具帮助您将数据转换成对基因组分析和研究有意义的结果。

数据可视化与分析

利用GenomeStudio软件将Illumina芯片平台产生的数据可视化并进行分析。

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GenomeStudio Software

您可以通过查看GenomeStudio项目来熟悉我们的基因分型数据。GenomeStudio项目为小样本集,包含了法国人类多态性研究中心(CEPH)12个样本,其中含有两个重复,利用Illumina HumanOmni5-Quad beadchip进行基因分型。该产品利用了强大的tagSNP,将遗传变异降至1%的最小等位基因频率。

该四样本BeadChip运用了Infinium LCG实验分析方法,为全基因组基因分型和CNV应用提供高通量的样本处理和优化的内容。了解如何利用GenomeStudio优化样本的检出,并且能以直接导入下游分析工具的格式运行报告。

您可以在Illumina芯片支持下载的HumanOmni5-Quad v1.0支持文档下找到HumanOmni5-Quad v1.0演示数据。在此了解有关该产品的更多内容。

我们推荐使用GenomeStudio GT Module v1.0 User Guide进一步了解该软件所提供的功能以及以与下游分析兼容的格式导出数据的方法。

Illumina FastTrack Service分析方法

了解Illumina FTS如何利用GenomeStudio分析基因分型数据,获得优化的基因分型检出。

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研究人员可以利用HumanMethylation450 BeadChip在单核苷酸分辨率水平上,每个样本可检测超过485,000个甲基化位点。GenomeStudio甲基化数据分析模块计算甲基化水平(beta值),分析实验组之间的差异甲基化水平。单位点分辨率数据可被可视化为线条图、条形图、散点图、直方图、树状图、箱形图或热图。演示数据集提供在Humanmethylation450 BeadChip上运行的法国人类多态性研究中心(CEPH)样本的数据,其包含两个重复。

您可以在GenomeStudio支持下载页面的Genome Software 2011.1下找到HumanMethylation 450演示数据集。在此可以了解有关该产品的更多内容。

我们推荐使用GenomeStudio Methylation Module v1.8 User Guide进一步了解该软件所提供的功能以及以与下游分析兼容的格式导出数据的方法。

分析Infinium项目

如想了解更多关于如何分析Infinium芯片项目的信息,请查看本培训课程。

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