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新一代测序的成本

重新定义探索所需的成本

重新定义探索所需的成本

自从人类基因组计划完成以来,新一代测序(NGS)成本降低的速度已经大大超过了摩尔定律。通过不断的创新,Illumina为降低NGS的成本做出了贡献,实现了1000美元的人类基因组测序。

随着新一代测序成本的持续降低,Illumina正引领着行业的发展,促使NGS更经济实惠、更加普及。我们致力于帮助各种规模的实验室充分利用这项强大技术的潜力。利用这些资源,我们将指导您了解规划NGS预算时需要考虑的关键因素。

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新一代测序的成本比较

评估NGS成本时需考虑研究的样本量。一般而言,分析少量样本的少量靶点(<20)可以使用传统的方法,比如桑格测序或qPCR。NGS更适合超过20个目标区域或高样本量的测序。

NGS的探索能力更强,灵敏度更高,可以检测新的或罕见的变异。它提供了一种无假设的方法,不需要事先了解序列信息。这些见解对于探索发现和推动研究成果非常有用。

深入了解:
NGS vs. qPCR
NGS vs. 桑格测序
NGS vs. 芯片

新一代测序的成本考量

预估NGS成本时需考虑以下因素:

  • 仪器购买
  • 每个样本的成本(比如,DNA分离、文库制备及测序试剂)
  • 数据分析和存储
  • 可选的仪器支持计划
  • 可选的培训和预防性维护

还需考量其他的实验设备,比如:

  • 核酸定量仪器
  • 核酸质量分析仪
  • PCR仪
  • 超声波破碎仪(用于某些文库制备方法)
  • 离心机
  • 常见的实验室用品(比如,移液器、96孔板、离心管)
NGS系统购买指南

查找注意事项,助您估算新一代测序的成本,为您的实验室选择合适的仪器。

下载指南

每个样本的NGS成本示例

应用每个样本的估算成本实验参数
靶向基因表达图谱23美元

根据采用的运行计算每个样本的成本:

  • MiniSeq系统
  • 65个靶点
  • 1000倍的覆盖度
  • 1 × 150 bp的读长
  • TruSeq Targeted RNA Expression Custom Panel Kit
  • MiniSeq Reagent High Output Kit(75个循环)
16S宏基因组测序18美元

根据采用的运行计算每个样本的成本:

  • MiSeq系统
  • 96个样本
  • 2 × 300 bp的读长
  • Nextera XT Index引物
  • MiSeq Reagent Kit v3(600个循环)
低成本NGS仪器

iSeq 100测序系统简约的设计让新一代测序比以往更简单,也更经济。无需投入更多成本即可发现更多信息。

查看系统
低成本NGS仪器

NGS数据分析的成本

NGS数据储存与分析的成本是新手最常见的问题之一。有三个因素会影响您的数据分析预算:

  • 获得数据分析软件平台的授权许可
  • 储存数据(通常是授权成本的一部分)
  • 运行数据分析应用程序(也称为计算成本)

计算成本会随着分析的测序数据量而变化。为了帮助您计算研究中NGS数据分析的成本,我们估算了常用方法生成的数据量。

常见NGS应用的数据产出
应用估算数据产出
人类全基因组测序(30倍的覆盖度)~120 Gb
人类外显子组测序(100倍的覆盖度)~8 Gb
微生物全基因组测序~300 Mb
16S rRNA测序~60 Mb

1兆碱基(Mb)= 1,000,000碱基
1千兆碱基(Gb)= 1,000,000,000碱基

生成的数据量与实验的测序覆盖度水平有关。

了解更多
BaseSpace Sequence Hub
免费试用NGS数据分析

在BaseSpace Sequence Hub上免费试用数据分析应用程序30天,无需购买仪器。您还将获得250点免费赠送的iCredit,可用于支付额外的储存或计算费用。

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NGS实验设计

了解读长、测序覆盖度等第一次测序运行所需的一切。

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NGS实验设计

NGS成本的常见问题

为测序仪布置实验室空间时,请确保它不会受到过度振动或温度波动的影响。如果您的实验室还没有PCR前和PCR后实验区域,请考虑建造两个独立的房间,或隔出实验台以避免NGS实验中的PCR污染。
您可以选择培训和安装服务,无需专门的实验室人员进行仪器维护。iSeq 100系统是我们最实惠的测序仪,自行安装简单方便。我们的仪器具有内部质量控制,可以指导您运行系统检查。我们还提供全面的服务计划,我们的科学家和工程师可以为您提供额外支持,回答您的疑问。

本基金撰写辅助文档适用于iSeq 100系统,可以在基金申请中帮助您证明资金的合理性。
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您可以通过多重测序,将多个文库混合在一起然后同时测序。多重分析大大增加了每次运行可分析的样本数量,但不会显著增加成本或时间。
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我们有设备抵换计划、租赁方案和捆绑销售,可以帮助您开始进行NGS。探索不同的购买选项,找到最符合您需求的仪器。
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借助我们交互式测序平台比较工具来查找最符合您需求的系统。

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想要了解我们的产品或者是NGS?请联系我们的销售代表。