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Cellular & Molecular Biology, 微生物基因组学, 微生物

利用COVIDSeq™支持印度一线COVID-19检测

利用新一代测序检测COVID-19

利用COVIDSeq™支持印度一线COVID-19检测
2020年8月13日
目前,印度的COVID-19患者接近240万例,患者总人数在全球排名第三,提高其检测能力对于遏制病毒的持续传播至关重要。位于新德里的基因组学和整合生物学研究所(IGIB)是印度科学与工业研究理事会(CSIR)的一个主要研究所,该研究所评估了Illumina COVIDSeq™在SARS-CoV-2检测方面的研究分析能力。COVIDSeq是一种基于高通量新一代测序的分析方法,采用NovaSeq™ 6000测序系统在24小时内即可生成结果,可通过安装在本地DRAGEN™ Bio-IT平台上的COVIDSeq检测开展高度精确的超快速分析。IGIB生成的数据表明,与定量聚合酶链式反应(qPCR)检测相比,该检测的灵敏度更高,总体诊断率提高了8-10%。

除了CSIR-IGIB,我们还与世界各地的许多客户展开了合作,为COVID-19检测提供新一代测序

COVIDSeq可准确识别出更多阳性样本,这种灵敏度的改善有助于减少COVID-19的误诊,从而限制病毒的传播。IGIB的验证表明,COVIDSeq是一种高度灵敏的SARS-CoV-2检测方法。该检测还生成了整个SARS-COV-2基因组的序列信息,有助于基于基因的追踪工作,更好地了解病毒的传播情况。

IGIB正在评估COVIDSeq,希望能提高一线检测的可用性,同时获得可用于监测病毒传播的分子流行病学信息。

“COVIDSeq验证的完成表明我们在帮助印度抗击疫情和对新冠病毒进行分类方面取得了重要进展,”CSIR基因组学和整合生物学研究所主任Anurag Agarwal说道。“Illumina的技术有可能显著提升印度的COVID-19检测能力,使我们更好地控制疫情。”

COVIDSeq可在确认出现症状的患者身上是否有病毒的同时,对病毒基因组进行测序,为追踪COVID-19提供宝贵资源。COVIDSeq提供的基因组覆盖度有助于进行遗传流行病学调查和对分离株进行系统进化分类。这些信息有助于进一步了解疫情发生的情况,对于采用循证方法来阻止疾病的传播至关重要。

“除了CSIR-IGIB,我们还与世界各地的许多客户展开了合作,为COVID-19检测提供新一代测序,”Gretchen Weightman,Illumina副总裁兼亚太及日本地区总经理说道。“CSIR-IGIB使用COVIDSeq获得的商业验证结果具有重要的意义,它证明了该产品可满足抗击COVID-19大流行的全球需求,具有检测所需的可扩展性。”

 

*https://coronavirus.jhu.edu/map.html

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