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Illumina Reaches Milestone with 1,000 NovaSeq™ 6000

发布三年后,NovaSeq让获得更深入的发现变得比以往任何时候都更容易

Illumina Reaches Milestone with 1,000 NovaSeq™ 6000
2020年8月26日

在产出和降低每个read的成本方面,NovaSeq实现了重大飞跃。

三年前,Illumina推出其最强大的测序仪。而现在,我们已经安装了第1,000台 NovaSeqTM 6000测序系统。就在2020年6月,我们在马萨诸塞州剑桥的怀特海德生物医学研究所安装了这台测序仪。

作为较早采用基因组测序技术的研究所,怀特海德的研究人员在2007年就开始使用Solexa测序仪。“在几个月后,Illumina便收购了Solexa”怀特海德基因组技术中心的负责人Thomas Volkert说道。“他们首先做的就是去掉Solexa的商标,再换上自己的商标。遗憾的是我没有保留之前Solexa仪器上的内容。这是值得收藏的内容。”

“那是我们使用的第一台测序仪,”他接着说,“但没过三四个月,我们就意识到我们需要第二台测序仪。”从那时起,实验室就针对HiSeq测序仪进行了升级,我们的HiSeqTM 2500使用了很多年。之后,我们决定购买NovaSeq 6000,这刚好是Illumina安装的第1,000台NovaSeq。

发挥作用

在购买NovaSeq 6000之前,怀特海德已经进行了长时间的基因组研究,发现了很多重要的信息。Young的实验室曾采用中心的三台HiSeq测序仪来研究转录调控,使用了染色质免疫沉淀(ChIP)和其他技术。

领导怀特海德研究所长达15年之久的David Page曾采用RNA-Seq来研究基因表达。他特别想了解特定组织的基因组在男性和女性体内的表现是否有差异。

最近,怀特海德的研究人员开始在单细胞水平上研究肺对冠状病毒和其他感染的反应。他们开始对单细胞测序感兴趣,这也是我们购买NovaSeq 6000的一个原因。

“在产出和降低每个read的成本方面,NovaSeq实现了重大飞跃。”Volert说道。“采用这台仪器,我们可以将单细胞测序的价格降低一半,大大节省了成本。”

提高可及性

在安装第1,000台NovaSeq 6000的过程中,Illumina宣布了另一个具有历史意义的里程碑:600美元的基因组。NovaSeq 6000 v1.5 Reagent Kit使其成为了可能,该试剂盒与NovaSeq 6000一起使用时,可通过极大的灵活性、准确性和规模来加快实现科学突破的速度。

有了600美元的基因组,像怀特海德这样的实验室将受益匪浅。“降低成本能让实验设计的规模越来越大。”Volkert说道。“在NGS领域,价格是非常重要的因素。一些实验设计常因为资金不足而被削减。成本的降低可使研究人员更加自如地开展真正想做的研究,不为成本所困。”

 

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