人类微生物组分析简介
人类微生物组分析是对人体表面及体内微生物群落的研究。人类微生物组分析旨在了解微生物对健康和疾病的影响。
在以前，研究人类的皮肤、粪便或血液样本需要培养和分离单个生物，然后进行表型或基因型分析，这种微生物学技术费时费力。而且这些方法无法在单个样本中进行微生物群落分析。 人类微生物组分析简介
用于人类微生物组研究的新一代测序
NGS的高通量和成本的降低促进了宏基因组学研究，该研究能够研究整个群落的基因组，包括那些无法培养的生物体的基因组。
用于分析人体微生物组的实验性NGS方法包括：
鸟枪法宏基因组测序
- 一种DNA测序方法，能够对给定的复杂样本中存在的所有生物体的所有基因进行全面的检测。
16S rRNA测序
- 一种16S核糖体RNA基因测序方法，用于鉴定和比较给定样本中的细菌。
微生物宏转录组学
- 对复杂样本中的一组微生物编码的所有RNA进行分析。
Topics in Human Microbiome Research
Gene-Level Metagenomics for Microbiome Research
This webcast will introduce a novel gene-level bioinformatics approach for identifying microbial species and strains associated with human disease from metagenomic sequencing data sets. Samuel Minot, PhD will also demonstrate an interactive microbiome discovery portal.
Register NowMicrobiome Sequencing in High-host and
Low-biomass Samples
This webcast will discuss new sequencing methods, including those generating synthetic long reads, with a focus on their relevance for microbial community analysis. Dr. Stefan J. Green will address practical approaches to high host and low microbial biomass issues.
Register Now在进行微生物转录组学研究时去除rRNA
Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit可在进行RNA-Seq前去除rRNA，让您专注于转录组的高价值部分。该技术说明展示了该试剂盒在微生物分离物和群落样本中去除rRNA的能力，并与之前版本的试剂盒进行了比较。
阅读技术说明
探索NextSeq 2000
NextSeq 2000支持高通量测序应用。该系统历经75次以上的更新，采用干仪器和简捷的运行设置，可利用机载DRAGEN软件实现快速的二级分析。您可以通过该仪器体验我们最简单的工作流程，了解外显子组测序、靶向富集、单细胞分析和转录组测序的强大功能。
了解更多
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参考文献
- The Human Microbiome Consortium (2012) A framework for human microbiome research Nature 48: 215–221.
- Qin J, Li Y, Cai Z, Li S, Zhu J et al. (2012) A metagenome-wide association of gut microbiota in type 2 diabetes. Nature 490:55–60.
- Maurice CF, Haiser HJ, Turnbaugh PJ. (2013) Xenobiotics shape the physiology and gene expression of the active human gut microbiome. Cell 152:39–50.
- Karlsson FH, Tremaroli V, Nookaew I, Bergstrӧm G, Behre CJ, et al. (2013) Gut metagenome in European women with normal, impaired and diabetic glucose control. Nature 498:99–103.
- Penders J, Stobberingh EE, Savelkoul PH, Wolffs PE. (2013) The human microbiome as a reservoir of antimicrobial resistance. Front Microbiol 4:87.